2018年，海口港有秀英、新海、马村3处港区，有码头泊位（指生产性泊位，下同）46个，其中秀英港区泊位20个（万吨级泊位5个）；新海港区18个泊位（万吨级泊位）；马村港区泊位8个（万吨级泊位）。在海口市注册登记的航运企业共44家，其中：水路运输企业21家（普通货物运输企业11家，化学危险品运输企业4家，客运企业6家），水运辅助企业23家。船舶总吨位超万吨规模以上的水路运输企业共8家。水路运输企业共有123艘营运船舶，198万总吨、290.7万载重吨、45260标准箱、1317车位，26166客位，其中普通货船62艘、油船10艘、液化气体船2艘、客船49艘。

2018年，在海口市注册的水路运输企业共完成旅客运输930万人次，下降8.1%；旅客周转量3.23亿人千米，增长2.29%。完成水路运输货物运输6141万吨，增长2.25%；货物周转量442.37亿吨千米，增长10%。海口港区货物吞吐量1.08亿吨，增长6.4%。集装箱吞吐量184.6万标准箱，增长12.8%，其中进口集装箱吞吐量91.1万标准箱，增长11.5%；出口集装箱吞吐量93.5万标准箱，增长14.2%。旅客进出港人数1514.1万人次，增长1%。其中进港人数739.9万人次，下降0.6%；出港人数774.2万人次，增长2.6%。滚装汽车吞吐量329.2万辆，增长8.4%。其中，进港汽车吞吐量165.6万辆，增长6.9%；出港汽车吞吐量163.6万辆，增长9.9%。