秀英区地处琼州海峡南岸，主要为沉积较厚的新生代第四系下更新统秀英组地层。这是一套海陆交互沉积相地层。由于伴随多期次火山喷发，地层中夹有多层火山岩。总体上地势平缓，海拔较低，西南高东北低，最高点为石山镇马鞍岭，海拔222.6米，最低点为西秀镇拔南村拔南田洋出海口，海拔0.5米。陆域大部分为平原，少数为三、四级台阶平原丘陵。地貌类型主要有火山地貌——熔岩台地、海成地貌——海积阶地、风成地貌——固定性沙滩等。港湾与近海还有少许岛礁和潮滩。